1999年开始，博巴迪拉就入选了巴拉圭国家队，但一直是奇拉维特的替补。

　　2006年，博巴迪拉跟随巴拉圭参加了德国世界杯，在首场与英格兰的比赛中，主力门将比拉尔受伤，博巴迪拉临时顶替成为球队首发门将，但最终巴拉圭排名小组第三出局。

　　国家队出场：17次，进球0个。